رئيس دولت اصلاحات گفت: سالهاست تفکري که هيچ نسبتي با انديشه امام و آيت الله طالقاني و جهت گيري‌‏هاي ايشان ندارد، مي‌‏خواهد خودش را متصدي و متولي انقلاب و تنها سخنگوي ارزش‌‏هاي انقلاب معرفي کند.

سيد محمد خاتمي در گفت‌‏وگوي با خبرنگار "ايلنا"، با اشاره به ويژگي‌‏هاي شخصيتي آيت‌‏ الله طالقاني گفت: آيت الله طالقاني از سرمايه‌‏هاي بزرگي است که در يک و نيم قرن گذشته جايگاه و پايگاه بسيار بالايي هم در تفکر ديني و هم در حرکت‌‏هاي اجتماعي جامعه ما داشته است. 

وي افزود: آيت الله طالقاني جايگاه ممتازي را در جامعه و تاريخ ما دارد. 

خاتمي با کم نظير دانستن شخصيت آيت الله طالقاني اظهار داشت: آيت الله طالقاني يک عالم ديني، زاهد، متقي و روشن فکري بود که دغدغه دين داشتن او عين دغدغه‌‏اش نسبت به سرنوشت مردم بود. 

وي تصريح کرد: در انديشه آيت الله طالقاني حق حاکميت مردم به سرنوشت خويش و اينکه اسلام به گونه‌‏اي است که اگر حاکم شود،مردم داراي رشد فکري و برخوردار از مزاياي زندگي مي‌‏شوند،‌‏ نمود بارزي داشت. 

رئيس‌‏جمهور پيشين کشورمان در ادامه تاکيد کرد: آيت الله طالقاني يکي از سردمداران و سرآمدان روشنفکري ديني بود که در عين پايبندي به معيارهاي ديني به عنوان يک عالم دين، دغدغه‌‏هاي يک روشنفکر را نسبت به سرنوشت، حقوق و آزادي انسان داشت.
وي افزود: ايشان ايران را آباد،‌ آزاد و سربلند مي‌‏خواست. 

سيد محمد خاتمي با اشاره به مبارزات آيت الله طالقاني در رژيم گذشته اظهار داشت: ‌‏آيت الله طالقاني علاوه بر فعاليت‌‏هاي فکري مبارزات ارزنده و طولاني با رژيمي که هم مستبد و هم وابسته به بيگانه بود، داشتند. 

وي به رابطه حضرت امام(ره) و آيت الله طالقاني اشاره کرد و گفت: عنايتي که حضرت امام(ره) نسبت به ايشان داشتند هم به عنوان اولين امام جمعه اي که منصوب کردند و نيز اطلاعيه‌‏اي که بعد از رحلت ايشان صادر کردند نشانه‌‏اي از توجه امام به شخصيت بي‌‏بديل و بي‌‏نظير آيت الله طالقاني بود. 

رئيس دولت اصلاحات تصريح کرد: متاسفم که سال‌‏هاست تفکر و روشي که هيچ نسبتي با تفکر امام و تفکر آيت الله طالقاني و جهت گيري‌‏هاي ايشان ندارد مي‌‏خواهد خودش را به عنوان متصدي و متولي انقلاب و تنها سخنگوي ارزش‌‏هاي انقلاب معرفي کند.
وي افزود: در حالي‌‏که همه مي‌‏دانند آن تفکر قبل ازانقلاب هم با امام درمعارضه بود و بعد از انقلاب هم مورد توجه امام نبود و امروز نيز براي ميدان دار شدن تلاش مي‌‏كند. 

خاتمي با اشاره به احياء مساله شوراها در دولت اصلاحات، اظهار داشت: همانگونه كه همه مي‌‏دانيم اهتمام به امر شوراها از ويژگي‌‏هاي تفكر و موضع‌‏گيري‌‏هاي آيت الله طالقاني بود و اين فكر مبتني بر اين اصل است كه كار مردم بدست خود مردم بايد باشد و خوشبختانه اصل شوراها از اصول مترقي قانون اساسي ماست و خدا را سپاسگزارم كه پس از دو دهه در دوران دولت پيشين اين اصل مهم ومعطل مانده پياده شد و امروز همه شاهد نتايج و بركات آن هستيم.