امام خمینی(ره) در متن فرمان نخست وزیری بازرگان اینگونه مرقوم کرده بودند: «بنا به پیشنهاد شورای انقلاب، جناب عالی را بدون در نظر گرفتن روابط حزبی و بستگی به گروهی خاص مامور تشکیل دولت موقت می نمایم.» با گذشت نه ماه از روی کار آمدن دولت بازرگان و دو روز پس از آن که دانشچویان پیرو خط امام سفارت آمریکا را به اشغال خود درآوردند، استعفا کرد.